Στα πλαίσια της ανάπτυξης περιβαλλοντικών πολιτικών στο Πανεπιστήμιο Αιγαίου εφαρμόστηκε μεθοδολογία εκτίμησης των σημαντικότερων περιβαλλοντικών επιπτώσεων της λειτουργίας του Τμήματος Περιβάλλοντος.

Οι τομείς προτεραιότητας που αναδείχθηκαν είναι οι ακόλουθοι:

• Βελτίωση ενεργειακής αποδοτικότητας
• Μείωση της κατανάλωσης νερού
• Μείωση των στερεών αποβλήτων μέσω ανακύκλωση / επαναχρησιμοποίησης
• Προώθηση οικολογικών προμηθειών 
• Προαγωγή οικολογικών μετακινήσεων
• Προαγωγής της υγιεινής και ασφάλειας